Król Francji
król Henryk IV
Koronacja hugenota Henryka IV stała się powodem wzniecenia przez Ligę Katolicką kolejnej, niezwykle krwawej, domowej wojny religijnej, która toczyła się, ze zmiennym szczęściem, również przy udziale wojsk hiszpańskich, przez oktet lat. Skończyła się w 1598 r. układem pokojowym wśród Francją i Hiszpanią, po tym jako Henryk IV w 1593r. przeszedł nazad na katolicyzm („Paryż wart jest mszy!”). W tedy 1598 roku Henryk IV wydał anulowany odtąd w 1685r. edykt nantejski, zrównujący w prawach protestantów i katolików i usuwający w ten sposób przyczyny wojen religijnych we Francji. Edykt przyznawał protestantom system legislacyjny praktykowania wiary, budowy własnych kościołów, posiadania zamków itd. Nie obowiązywał natomiast w kilku miastach, tudzież w Paryżu raptem w dzielnicy Charenton. Był więc kompromisem, jaki nie zadowalał całkowicie ani protestantów, ani katolików. Pozwolił jednakże na kilkanaście lat wewnętrznego pokoju.
W 1599 jego małżeństwo z Małgorzatą zostało unieważnione. rok później ożenił się z toskańską księżniczką Marią Medycejską, która została matką jego wszystkich legalnych potomków i regentką po jego śmierci.